Villa Loghino è costruita ai piedi di un poggio boscoso, sulla riva destra del fiume Era, in una zona ricca di percorsi escursionistici che si diramano tra boschi, corsi d'acqua e calanchi, nel cuore del più suggestivo paesaggio toscano.
Si erge in aperta campagna, completamente raccolta in variopinte tonalità di verde, quasi a guardia di una fauna locale ancora molto numerosa.
Villa Loghino si trova a 5 km dalla storica città di Volterra, la sua ubicazione consente a chi vi soggiorna di raggiungere facilmente il mare (40Km) e le principali città d'arte tra le quali Siena (50Km), San Gimignano (20Km), Firenze (90Km) e Pisa (60Km).
Nella storia si legge che Villa Loghino è stata in origine il primo frantoio di Volterra, agevolato dalla vicinanza dei campi di raccolta delle olive e dall'abbondanza di acqua portata dal fiume. Abbandonato, divenne la riservata dimora di un cardinale e dopo, solo per pochi anni, è stata abitata da alcune famiglie di contadini.
Nel 1980 l'intera proprietà venne acquistata dai coniugi Carla e Vittorio Scali, che cominciarono da subito un'accurata ristrutturazione della casa padronale con l'intenzione di farne la loro residenza estiva.